Pierwszy okres rozliczeniowy nEHS jest podzielony na dwie fazy:

W pierwszej fazie 2021-2025 - zwanej również fazą wstępną - nEHS działa mniej więcej jak podatek. Przy sukcesywnie rosnących stałych cenach od 25 euro za tonę w 2021 r. do 55 euro za tonę w 2025 r., giełda energii w Lipsku, European Energy Exchange (EEX), będzie sprzedawać tyle certyfikatów, na ile będzie popyt.

Jeśli popyt na certyfikaty w danym roku przekroczy przydziały emisji wydane przez UE, Niemcy muszą albo dokonać kompensacyjnych redukcji emisji w innych sektorach krajowych poza nETS, albo zakupić przydziały emisji od innych państw członkowskich UE, które przekroczyły swoje cele emisyjne.

Uprawnienia do emisji (nEZ), które mają być zarządzane na rachunku rejestru nEHS, mają dwa oznaczenia:

• znacznik identyfikujący rok kalendarzowy, na który uprawnienie zostało wydane
• drugie oznaczenie wskazujące okres rozliczeniowy, na który uprawnienie zostało wydane.

Certyfikaty wydane na rok X nie mogą być wykorzystane do umorzenia w roku X+1. Oznaczenie roku kalendarzowego wynika ze ścisłej struktury cenowej. Tylko za pomocą tego oznaczenia można wykluczyć możliwość przeniesienia uprawnień na przyszłe lata ("bankowanie") w latach o stałej cenie, zapobiegając w ten sposób kosztownej sprzedaży uprawnień zakupionych tanio w poprzednim roku.

Wypełnienie obowiązku umorzenia za rok sprawozdawczy można jednak zawsze wykonać za pomocą certyfikatów wydanych w latach następujących po roku sprawozdawczym.

W drugiej fazie 2026-2030 nEHS jest podobny do europejskiego systemu handlu uprawnieniami do emisji EU ETS.

Po fazie wstępnej, od 2026 r., dystrybutorzy będą musieli po raz pierwszy kupować uprawnienia do emisji na aukcjach w ustalonym korytarzu cenowym od 55 do 65 EUR za tonę. Planuje się, że certyfikaty, na które zapotrzebowanie przekracza przydziały emisji UE, będą musiały zostać zakupione po jeszcze nieznanej, wyższej stałej cenie.

Pierwotny plan zakładał przekształcenie nEHS w system „cap and trade” od 2027 r., tj. system handlu emisjami z bezwzględnymi limitami ilościowymi i cenami ustalanymi na wolnym rynku. Ponieważ nEHS ma zostać zastąpiony drugim europejskim systemem handlu uprawnieniami do emisji dla paliw (EU ETS 2) od 2027 r., jest to mało prawdopodobne.